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論文作者也指出AlphaFold3存在一些局限性,比如約4.4%的結(jié)構(gòu)會(huì)出現(xiàn)不正確的手性(一種對(duì)稱特性),或是幻覺導(dǎo)致“飄帶”(一種常見的蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)元素)的出現(xiàn)減少。
9770大发棋牌官网AlphaFold3能預(yù)測(cè)含有蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)銀行(Protein Data Bank)內(nèi)幾乎所有分子類型的復(fù)合物的結(jié)構(gòu)。這個(gè)最新迭代模型用計(jì)算機(jī)解析蛋白質(zhì)與其他分子復(fù)雜相互作用的能力,將拓展人們對(duì)生物過程的理解,并有望推動(dòng)藥物研發(fā)。
論文共同通訊作者、谷歌DeepMind的John M. Jumper和同事等研究認(rèn)為,在AlphaFold2模型的深度學(xué)習(xí)架構(gòu)和訓(xùn)練系統(tǒng)的大幅提升下,如今可以對(duì)一個(gè)統(tǒng)一框架內(nèi)大量生物分子系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)進(jìn)行更準(zhǔn)確的預(yù)測(cè)。AlphaFold3能預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)與其他蛋白質(zhì)、核酸、小分子、離子、修飾蛋白質(zhì)殘基的復(fù)合物,以及抗體-抗原相互作用。預(yù)測(cè)準(zhǔn)確性顯著超過當(dāng)前預(yù)測(cè)工具,包括AlphaFold-Multimer。
該論文介紹,AlphaFold首次于2020年問世,它和迭代版AlphaFold2能根據(jù)蛋白質(zhì)的氨基酸(蛋白質(zhì)的基本成分)序列預(yù)測(cè)其3D結(jié)構(gòu)。之后的AlphaFold-Multimer推動(dòng)了對(duì)蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)復(fù)合物的預(yù)測(cè)。不過,擴(kuò)大單一深度學(xué)習(xí)模型能預(yù)測(cè)的復(fù)合物范圍一直很難,因?yàn)椴煌愋偷奶禺愋韵嗷プ饔貌町愄蟆?/p>
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