28kyingshi

該研究中，研究人員通過全基因組和轉錄組測序分析發(fā)現(xiàn)在線粒體基因組和非編碼區(qū)域中也存在與疾病相關的突變，并對與疾病進展顯著相關的突變進行了系統(tǒng)性的總結，這些突破性的發(fā)現(xiàn)填補了非編碼區(qū)在結直腸癌相關研究中的空白，將進一步推動對結直腸癌發(fā)病機制的理解。

28kyingshi據(jù)介紹，全球每年新增結直腸癌病例約190萬，結直腸癌發(fā)病率居所有癌癥第三位，約20%的患者在確診時已發(fā)生轉移，結直腸癌死亡率高居各類癌癥第二位。

該研究基于華大智造DNBSEQ測序平臺，對瑞典知名癌癥樣本與數(shù)據(jù)庫U-CAN隊列中的1063例結直腸癌樣本進行全基因組和轉錄組測序分析，鑒定得到了96個顯著突變基因，其中，有24個為新發(fā)現(xiàn)的潛在驅動基因，而與WNT, EGFR和TGF-β通路相關的驅動基因與結直腸癌生存顯著相關。不僅如此，研究人員還利用突變時序分析，推導出了9個與癌癥發(fā)生早期事件相關的驅動突變基因，和更傾向于在癌癥發(fā)生的后期階段出現(xiàn)的突變基因。這些發(fā)現(xiàn)為結直腸癌的早期檢測和靶向治療的開發(fā)提供了臨床研究策略，并揭示了與腫瘤后期侵襲和轉移相關的重要分子變化。

隨后，分析團隊利用同一腫瘤樣本的基因組和轉錄組數(shù)據(jù)進行了整合分析，驗證了無論是否為微衛(wèi)星不穩(wěn)定腫瘤，其抑癌基因上的突變均導致基因表達降低，從而更容易患癌。進一步地，研究團隊基于腫瘤基因表達差異，將結直腸癌預后分為了5個預后亞型CRPS，相較于結直腸癌經(jīng)典的共識分子分型CMS，該研究構建的CRPS能更加準確地預測預后。

文章通訊作者、烏普薩拉大學的Tobias Sjöblom教授表示，該研究實現(xiàn)了迄今為止最大規(guī)模的結直腸癌基因組和轉錄組的綜合分析，并將分子層面的發(fā)現(xiàn)與高質量的臨床數(shù)據(jù)相結合，從而識別關鍵預后因子，這使這項研究有別于其他絕大多數(shù)癌癥基因組學的研究。