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該研究中，研究人員通過全基因組和轉(zhuǎn)錄組測序分析發(fā)現(xiàn)在線粒體基因組和非編碼區(qū)域中也存在與疾病相關(guān)的突變，并對與疾病進(jìn)展顯著相關(guān)的突變進(jìn)行了系統(tǒng)性的總結(jié)，這些突破性的發(fā)現(xiàn)填補(bǔ)了非編碼區(qū)在結(jié)直腸癌相關(guān)研究中的空白，將進(jìn)一步推動(dòng)對結(jié)直腸癌發(fā)病機(jī)制的理解。

該研究基于華大智造DNBSEQ測序平臺，對瑞典知名癌癥樣本與數(shù)據(jù)庫U-CAN隊(duì)列中的1063例結(jié)直腸癌樣本進(jìn)行全基因組和轉(zhuǎn)錄組測序分析，鑒定得到了96個(gè)顯著突變基因，其中，有24個(gè)為新發(fā)現(xiàn)的潛在驅(qū)動(dòng)基因，而與WNT, EGFR和TGF-β通路相關(guān)的驅(qū)動(dòng)基因與結(jié)直腸癌生存顯著相關(guān)。不僅如此，研究人員還利用突變時(shí)序分析，推導(dǎo)出了9個(gè)與癌癥發(fā)生早期事件相關(guān)的驅(qū)動(dòng)突變基因，和更傾向于在癌癥發(fā)生的后期階段出現(xiàn)的突變基因。這些發(fā)現(xiàn)為結(jié)直腸癌的早期檢測和靶向治療的開發(fā)提供了臨床研究策略，并揭示了與腫瘤后期侵襲和轉(zhuǎn)移相關(guān)的重要分子變化。

威尼斯官方网站入口據(jù)介紹，全球每年新增結(jié)直腸癌病例約190萬，結(jié)直腸癌發(fā)病率居所有癌癥第三位，約20%的患者在確診時(shí)已發(fā)生轉(zhuǎn)移，結(jié)直腸癌死亡率高居各類癌癥第二位。

隨后，分析團(tuán)隊(duì)利用同一腫瘤樣本的基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行了整合分析，驗(yàn)證了無論是否為微衛(wèi)星不穩(wěn)定腫瘤，其抑癌基因上的突變均導(dǎo)致基因表達(dá)降低，從而更容易患癌。進(jìn)一步地，研究團(tuán)隊(duì)基于腫瘤基因表達(dá)差異，將結(jié)直腸癌預(yù)后分為了5個(gè)預(yù)后亞型CRPS，相較于結(jié)直腸癌經(jīng)典的共識分子分型CMS，該研究構(gòu)建的CRPS能更加準(zhǔn)確地預(yù)測預(yù)后。

文章通訊作者、烏普薩拉大學(xué)的Tobias Sjöblom教授表示，該研究實(shí)現(xiàn)了迄今為止最大規(guī)模的結(jié)直腸癌基因組和轉(zhuǎn)錄組的綜合分析，并將分子層面的發(fā)現(xiàn)與高質(zhì)量的臨床數(shù)據(jù)相結(jié)合，從而識別關(guān)鍵預(yù)后因子，這使這項(xiàng)研究有別于其他絕大多數(shù)癌癥基因組學(xué)的研究。